扶苏和蒙恬接到假诏后，扶苏自杀身亡，大将蒙恬被关进监牢，遭暗害而死。
到了咸阳，李斯等人发布秦始皇“驾崩”的消息并宣布皇帝“遗诏”，立胡亥为太子，并宣布继承皇位，是为秦二世。
秦二世胡亥主持秦始皇的丧葬仪式。九月，将秦始皇葬于骊山。在封墓时，二世令陪伴过秦始皇而无子女的妃子全部殉葬，到地下去侍奉秦始皇；又不等安装机关弩箭和布置宝藏的工匠出来就下令封闭墓门，把大批工匠活埋在墓道中，以免他们泄漏墓中机密，以谋求万世之安。
秦二世继位之后，杀死了十二个兄弟和十个姊妹，受到牵连的人不计其数。朝廷上下，人人自危。
丞相李斯曾辅佐秦始皇兼并六国出过大力，在沙丘政变中，又参与其中，深知内幕。二世继位后，李斯对修建庞大的阿房宫、扩充皇家马厩、征调武士五万人到咸阳警卫皇宫等极为不满，多次劝谏，二世先是不听，后来干脆避而不见。
赵高知道二世不满，也想谋杀李斯。便向二世诬告李斯的儿子李由任三川郡守时，同盗贼有来往。于是，二世将李斯下狱，便派赵高审问李斯。重刑之下，李斯苦熬不过，屈打成招。最后，秦二世二年七月，按律判李斯腰斩咸阳集市场。李斯出狱赴刑场时，对他的次子说：“我想和你们再牵黄狗一起离开上蔡东门去打猎追兔，难道还有机会吗？”于是父子痛哭流涕，都被杀害。最后诛灭了李斯三族。
李斯被杀后，二世更加信赖赵高，升任他为丞相。赵高居然指鹿为马，混淆是非；而秦二世也不闻不问，只顾玩乐享受。你可以想象，这样的局面能够维持多久？