上帝看到这一切，非常后悔创造了人，便发誓说：“我要将所造的飞鸟、走兽、昆虫和人都消灭掉。”但他又舍不得把他的造物全部毁掉，他希望新一代的人和动物能够悔过自新，建立一个理想的世界。
在罪孽深重的人们当中，只有诺亚一人在上帝眼前蒙恩。上帝认为他是一个重义人，守本分；他的三个儿子在父亲的严格教导下也没有误入歧途。诺亚以前经常告诫周围的人们，要赶紧停止作恶，从充满罪恶的生活中摆脱出来。但人们对他的话不以为然，继续我行我素，一味地作恶享乐。
于是，上帝选中了诺亚一家：诺亚夫妇、三个儿子——含、闪和雅弗——及其媳归，作为新一代人类的“种子”保存下来。上帝告诉他们，七天之后就要实施大毁灭，要他们用歌斐木造一只方舟，里外抹上松香。这只方舟要长132米、宽22米，高13.2米；方舟上方要留有透光的窗户，旁边要开一道门；方舟要分上中下三层。诺亚一家立即照办。
上帝看到方舟造好了，就对诺亚说：“看哪！我要使洪水在地上泛滥，毁灭天下，凡地上有血肉、有气息的活物无一不死。我却要与你立约，你同你的妻子、儿子、儿媳都要进入方舟。凡洁净的畜类，你要带七公七母；不洁净的畜类，你要带一公一母；空中的飞鸟也要带七公七母。它们都将成为‘种子’，将来在地上繁殖。”
二月十七日那天，是诺亚六百岁的生日。地上的大渊、泉源都裂开了，巨大的水柱从地下喷射而出；天上的窗户都敞开了，大雨日夜不停，下了整整四十天。水无处可泄，水位迅速上涨，比最高的山巅都要高出六七米。凡是在旱地上靠肺呼吸的动物都死了，只留下方舟里人和动物的“种子”安然无恙。方舟载着上帝的厚望漂泊在无边无际的汪洋上。
洪水汹涌，共泛滥了一百五十天。上帝惦念着诺亚方舟和里面的生灵，于是叫雨停住，让大风刮过，水势渐落。但是水退得很慢，雨停了一百五十天还看不到一片陆地。七月十七日，方舟搁浅在亚拉腊山上。到十月一日，山顶大都露出了水面。又过了四十天，诺亚开了方舟的窗户，放出一只乌鸦，让它去寻找陆地。但乌鸦飞来飞去，并没找到陆地。诺亚又放出一只鸽子，但那鸽子也飞回来了，因为找不到落脚休息的地方。七天以后，诺亚又把那只鸽子放出去。傍晚时分，鸽子噙着一根橄榄枝飞回来了，这意味着大地某个地方露出了陆地。等了七天，诺亚又把鸽子放出去，这回鸽子没有飞回来，因为大地干了，洪水全退了。
元月一日，诺亚撤去方舟的盖子眺望四野，看到地面已经变得干爽了，便和家人走出方舟，把方舟上的动物也都放了出来。诺亚筑了一座祭坛，拿各类洁净的牲畜、飞鸟供在坛上作为燔祭，奉献给上帝，以感谢他救命之恩。上帝闻到燔祭的馨香之气就在心里说：“我不再因人的缘故咒诅土地，也不再以这样的方式消灭各种活物了。只要土地还存在，稼穑、寒暑冬夏、昼夜就永不停息了。”
上帝赐福给诺亚和他的儿子们说：“你们要生养众多，遍满地面。凡地上的走兽和空中的飞鸟都必惧怕你们，连地上一切的昆虫并海里一切的鱼都交付在你们手中。凡活着的动物，都可以作你们的食物，这一切我都赐给你们，如同蔬菜一样。唯独带着血的肉，你们不可吃。流你们血、害你们命的，无论是兽是人，我必讨他的罪，就是各人的弟兄也是如此。凡流人血的，他的血也必被人所流，因为上帝造人是照自己的形象造的。你们要生养众多，在地上昌盛繁茂。”因为这道诫命，世界上信仰上帝的人大都不以动物的血或血制品为食。
上帝又与人和其他一切生灵立约，决定以后不再如此毁灭世界：“凡有血肉的不再被洪水灭绝，也不再有洪水毁坏土地了。”上帝用天上的七色彩虹作为盟约的标志，以此纪念他与地上的生灵订立的这个盟约。
为了重建家园，诺亚又重新干起了农活，他耕种土地，饲养牲畜，栽培葡萄园，还学会了酿酒。有一回他喝酒喝多了，昏醉中他把自己身上的衣服都扒光，赤身裸体地在帐篷里睡着了。他的儿子含，看见他光着身子酣睡在帐篷中，就笑着把这个情景告诉了两个兄弟。但闪和雅弗对父亲很尊敬，他俩拿了衣服把父亲的身子盖上，为了不看见父亲赤身，他俩是倒退着进入帐篷的。诺亚醒来后，知道了含的所作所为，大发脾气，他诅咒含，说他的后代必将成为闪和雅弗的奴隶。
洪水过去后，诺亚又活了三百五十岁，他是九百五十岁时死去的。诺亚三个儿子的后裔形成了人类的三大支系，居住在世界各地。雅弗是北方民族的始祖，闪是闪米特人的始祖，而含则是非洲民族——含米特人的始祖。
（希伯来神话）
姐弟的使命